Отныне (начиная с Windows Server 2008 R2 и Windows 7) файлы .VHD, известные как виртуальные диски, операционные системы Windows воспринимают как отдельные разделы и поддерживают загрузку ОС, установленных внутри этих файлов.
Вот подробная статья как установить Windows Server 2008 R2 или Windows 7 на виртуальный диск
http://news.softodrom.ru/ap/b4087.shtml
Ключевой момент один:
Загружаемся из под вновь устанавливаемой ОС с компашки или USB.
Когда приходит время разбивать жесткий диски (или выбирать раздел жесткого диска) топчем Shift+F10/
Запускаем diskpart
